bélflóra a bélrendszer természetes baktériumainak összessége, a bél mikrobaközössége (gut microbiota). Négyféle baktériumtörzs, Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria és a Actinobacteria tevődik össze. A bélflóra kétféleképpen szabályozza az immunrendszert: fokozhatja a természetes immunrendszert a TLR (Toll-like receptor) jelfogók (Tollszerű jelfogók) és/vagy az FFAR (free fatty acid receptor) jelfogók (szabad zsírsav jelfogók) serkentésével. Az utóbbiak a baktériumok anyagcseretermékeit, a rövidláncú zsírsavakat (acetát, proprionát, butirát [vajsav]) kapcsolják. Ezek az anyagcseretermékek elősegítik az éretlen T-sejtek szabályozó T-sejtekké (Tregs, regulatory T cells) alakulását vagy a bélbe vándorlását.
A bélflóra károsodása kóros immunválaszt válthat ki a béltársult immunszövetben (GALT; gut- associated lymphoid tissue), befolyásolva az immunrendszert: fokozhatja a TLR jelfogókon keresztüli immunfolyamatokat, másrészt csökken a rövidláncú zsírsavak keletkezése. Bélbetegségek, elhízás, cukorbetegség lehet a következmény.