MSH3 (MUTs homolog 3) DNA mismatch repair protein MSH3 a párhibajavítás egyik fehérjéje, az MSH3 gén kódolja, amely az 5-ös kromoszómán van. Az MSH2-vel kettőst képezve (MSH2–MSH3 [MUTsβ]) hatékony, a PCNA és az RFC fehérje együttes hatására válik tevékennyé.

Az MSH2–MSH3 kettős alakítja ki a leányszál (~20 bázispárnyi) kiöblösödését, amely tartalmazza a hibás bázispárt, valamint kapcsolja az MLH1–PMS2 kettőst.

A MSH3 gén hibájának szerepe van a méhtestrákok kialakulásában; veleszületett hibája a családi mirigyes polyposis-4 (FAP4, familiar adenomatous polyposis 4) okozója. (→párhibajavítás)